Налоговый орган вправе провести выездную налоговую проверку деятельности индивидуального предпринимателя. Но такое мероприятие налогового контроля, как правило, проводится в редких случаях.

1. Налоговая нагрузка по виду деятельности ниже среднеотраслевой.
2. Отражение в отчетности убытков на протяжении нескольких налоговых периодов.
3. Отражение в налоговой отчетности значительных сумм налоговых вычетов за период.
4. Темп роста расходов выше темпа роста доходов от реализации.
5. Среднемесячная заработная плата работника ниже средней по виду деятельности в субъекте Федерации.
6. Неоднократное приближение к предельному значению показателей, установленных для применения спецрежимов.
7. Максимальное приближение суммы расходов к сумме дохода за календарный год.
8. Построение хозяйственной деятельности на основе заключения договоров с контрагентами-перекупщиками или посредниками без разумной деловой цели.
9. Непредставление налоговому органу пояснений на уведомление о выявлении несоответствия показателей деятельности или запрашиваемых документов, или наличие информации об их уничтожении, порче.
10. Неоднократное снятие и постановка на учет в налоговых органах в связи с изменением места нахождения.
11. Значительное отклонение уровня рентабельности по данным бухгалтерского учета от уровня рентабельности в данной сфере деятельности по данным статистики.
12. Ведение финансово-хозяйственной деятельности с высоким налоговым риском.